Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms