Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms