Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc39a1Q9QZ03 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc39a1Q9QZ03 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms