Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Opn4Q9QXZ9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Opn4Q9QXZ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Opn4Q9QXZ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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