Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms