Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cbx8Q9QXV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms