Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcsk1nQ9QXV0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms