Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms