Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms