Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Apbb1Q9QXJ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apbb1Q9QXJ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms