Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChmQ9QXG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms