Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Limd1Q9QXD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limd1Q9QXD8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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