Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cln8Q9QUK3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cln8Q9QUK3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cln8Q9QUK3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cln8Q9QUK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cln8Q9QUK3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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