Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PolkQ9QUG2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms