Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc2lQ9JME7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms