Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfmbt1Q9JMD1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms