Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arl6ip4Q9JM93 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms