Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1aQ9JLR9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms