Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col5a3Q9JLI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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