Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tfr2Q9JKX3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfr2Q9JKX3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms