Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp4Q9JKV5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp4Q9JKV5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms