Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms