Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pole3Q9JKP7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pole3Q9JKP7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole3Q9JKP7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pole3Q9JKP7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pole3Q9JKP7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pole3Q9JKP7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pole3Q9JKP7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole3Q9JKP7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms