Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms