Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scamp5Q9JKD3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms