Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pard6bQ9JK83 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pard6bQ9JK83 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms