Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smad9Q9JIW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad9Q9JIW5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms