Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms