Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OtofQ9ESF1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtofQ9ESF1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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