Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trhr2Q9ERT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms