Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms