Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hipk3Q9ERH7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms