Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snap29Q9ERB0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms