Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dap3Q9ER88 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms