Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Capn12Q9ER56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms