Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a2Q9EQR4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms