Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pold3Q9EQ28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pold3Q9EQ28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350 ms