Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpv4Q9EPK8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpv4Q9EPK8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms