Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GabarapQ9DCD6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GabarapQ9DCD6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms