Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csnk1dQ9DC28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms