Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde1Q9DBZ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms