Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms