Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Riok3Q9DBU3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Riok3Q9DBU3 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms