Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prkar1aQ9DBC7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prkar1aQ9DBC7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prkar1aQ9DBC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prkar1aQ9DBC7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prkar1aQ9DBC7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkar1aQ9DBC7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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