Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms