Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph3bQ9DA80 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph3bQ9DA80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms