Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms