Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ift43Q9DA69 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift43Q9DA69 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms