Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S2

Tmem225, Transmembrane protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem225Q9D9S2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem225Q9D9S2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem225Q9D9S2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms