Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp12Q9D9M2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp12Q9D9M2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms